Добрый день Андрей! Я сталкивался с подобной ситуацией. Как и Вы я обыскал весь интернет в поисках решения, но как оказалось проблема уникальна. Я решил обратиться в сервисный центр Apple. Через пару дней мне перезвонили, и сообщили что нужно просто включить синхронизацию с iCloud и установить для контактов стандартную учётную запись — на iPhone. После проделанных манипуляций Ваши контакты перестанут удаляться.
